วัดดอยพระบาท สร้างมาเมื่อครั้งใดไม่ปรากฎหลักฐาน เป็นวัดโบราณที่มีอายุราวร้อยกว่าปี ซึ่งได้รับการบอกเล่าจากผู้เฒ่าผู้แก่สืบกันมา โดยมีรอยพระพุทธบาทประดิษฐานอยู่ใกลัพระเจดีย์ ราวปี พ.ศ. 2496 ต่อมาในปี พ.ศ. 2504 พ่อเลี้ยงคำปันแม่ฟองแก้ว ได้สร้างพระเจดีย์องค์ใหม่ครอบพระเจคีย์องค์เดิม วัดดอยพระบาท ได้รับพระราชทานวิสูงคามสีมา เมื่อวันที่ 16 มกราคม พ.ศ. 2518 และทำพิธีผูกพันธสีมาเดือน กรกฎาคม พ.ศ. 2518
